Ethan Hunt est rattrapé par la patrouille et doit rendre des comptes à ses pairs. Bien décidé à ne pas laisser "l'entité" gagner la partie, il va convaincre le gouvernement de lui laisser les coudées franches pour débusquer son code source et la détruire avant qu'elle ne nous mène à la fin de l'humanité. Il va devoir repousser ses limites une dernière fois, notamment en plongeant au plus profond de la mer Baltique, dans l'épave d'un sous-marin Russe...

Chase et sa petite amie Laine se rendent au "Horror Hound Festival", un festival pour passionnés d'horreur largement basé sur la légende locale, le "Creeper". Laine va rapidement avoir des visions du passé de la ville qui semble étroitement liée à ce monstre. Elle est persuadée que l'invocation d'une chose endormie depuis 23 ans vient d'être réalisée et qu'elle est au centre de la malédiction.

Un incident sur une structure nucléaire rends malade les enfants d'une petite bourgade Américaine. Leurs doigts deviennent noirs et ils se transforment en de dangereux "Zombies" qui brûlent tout ce qu'ils touchent de leurs mains. Seul moyen de les arrêter... leur couper.