Ethan Hunt est rattrapé par la patrouille et doit rendre des comptes à ses pairs. Bien décidé à ne pas laisser "l'entité" gagner la partie, il va convaincre le gouvernement de lui laisser les coudées franches pour débusquer son code source et la détruire avant qu'elle ne nous mène à la fin de l'humanité. Il va devoir repousser ses limites une dernière fois, notamment en plongeant au plus profond de la mer Baltique, dans l'épave d'un sous-marin Russe...

Après avoir réussi à s'échapper d'un commissariat grâce à l'intervention d'un étrange homme en noir, Michael Myers retourne à la base en passant par la sortie numéro 6...oups pardon... reprenons (sic)... Michael Myers donc, retourne au Q.G. de la secte qui le contrôle depuis sa naissance. Il doit maintenant repartir en chasse car sa nièce Jamie vit toujours et doit mourir ainsi que son enfant pour accomplir la prophétie. Et là Michael se pose une question existentielle... pourquoi je suis revenu, puisqu'il faut repartir...

Le monde est plongé en plein chaos depuis que les morts se sont relevés, attaquant les vivants afin de dévorer leur chair. Un petit groupe de survivants s'enfuit avec l'aide d'un pilote d'hélicoptère et se réfugie dans un centre commercial abandonné. Non sans difficultés, ils finissent par s'approprier les lieux. Alors qu'ils tentent de reconstruire un semblant de vie à l'intérieur, les choses empirent dehors et la situation devient vite incontrôlable...