Laissés livrés à eux mêmes après la disparition de leurs parents, Chloe et T.J. tentent de survivre avec le peu de moyens dont ils disposent. Après une tentative de vol qui a mal tourné, Chloe va devoir sauver son frère en s'introduisant dans une morgue contenant un cadavre qui pourrait le compromettre. Seul moyen d'y arriver, se faire passer pour un cadavre...

Un groupe de lycéens découvre un ancien sifflet de mort aztèque caché dans leur établissement. En soufflant dans cet objet maudit, ils libèrent une force surnaturelle qui révèle leurs morts futures. Traqués par les visions terrifiantes invoquées par le sifflet, les adolescents tentent d’échapper à leur destin. Alors que les victimes se multiplient, ils cherchent un moyen de briser la malédiction avant qu’il ne soit trop tard et que leur mort finisse réellement par les rattraper un par un.

Les champions de la terre révélés lors des précédents affrontements sont désormais rejoins par Johnny Cage, un acteur de seconde zone anciennement champion d'arts martiaux. Ils vont devoir s'unir pour combattre dans le "Mortal Kombat", un tournoi qui verra la faction gagnante prendre le contrôle de toutes les autres. Le monstrueux Shao Kahn se lance dans cette bataille sanglante et espère bien conquérir le royaume terre, Earthrealm, et tous ses défenseurs.