A la suite du décès de sa mère, Alice retourne dans la maison de son enfance. Peu à peu, elle va se rendre compte que la demeure est sous surveillance et qu'une mystérieuse présence semble rôder sur les lieux. Ses recherches de vérité vont finalement la conduire vers une révélation à la fois terrifiante et bouleversante.

Margaret est envoyée à Rome pour démarrer une nouvelle vie au service de l'Église. Autrefois enfant difficile, elle a trouvé son chemin gràce à la foi. Passée la découverte du magnifique Couvent où elle va séjourner, elle va peu à peu se sentir investir par les ténèbres enfouis en elle. Une machiavélique conspiration semble se mettre en place à ses dépens.

Les champions de la terre révélés lors des précédents affrontements sont désormais rejoins par Johnny Cage, un acteur de seconde zone anciennement champion d'arts martiaux. Ils vont devoir s'unir pour combattre dans le "Mortal Kombat", un tournoi qui verra la faction gagnante prendre le contrôle de toutes les autres. Le monstrueux Shao Kahn se lance dans cette bataille sanglante et espère bien conquérir le royaume terre, Earthrealm, et tous ses défenseurs.