Ethan Hunt est rattrapé par la patrouille et doit rendre des comptes à ses pairs. Bien décidé à ne pas laisser "l'entité" gagner la partie, il va convaincre le gouvernement de lui laisser les coudées franches pour débusquer son code source et la détruire avant qu'elle ne nous mène à la fin de l'humanité. Il va devoir repousser ses limites une dernière fois, notamment en plongeant au plus profond de la mer Baltique, dans l'épave d'un sous-marin Russe...

Une sénatrice Américaine vise le siège de la présidence des Etats-Unis et propose en premier lieu de faire annuler la "purge" qui sème terreur et désolation chaque année. Ses opposants vont profiter de cette monstrueuse soirée pour la faire exécuter. C'était sans compter sur Léo, survivant de la précédente purge, qui est devenu son chef de la sécurité.

Un vétéran du Vietnam revient aux Etats-Unis mais a perdu l'usage de la vue. Entrainé dans une tribu au combat et aux arts-martiaux, il décide de retrouver un ancien compagnon d'Armes mais se retrouve plongé dans une bien sombre histoire. Il lui fait la promesse de s'occuper de son fils et va tout faire pour le protéger contre une organisation mafieuse très dangereuse.