Une jeune fille est retrouvée morte d'une overdose dans une rue mal-famée de la ville. Son père, dévasté, apprend que peu de temps avant elle aurait participé au tournage d'une vidéo pornographique. Décidé à comprendre ce qu'il s'est vraiment passé, il va traquer ceux qui ont participé au film et les tenir pour responsable de la mort de sa fille..

A la suite du décès de sa mère, Alice retourne dans la maison de son enfance. Peu à peu, elle va se rendre compte que la demeure est sous surveillance et qu'une mystérieuse présence semble rôder sur les lieux. Ses recherches de vérité vont finalement la conduire vers une révélation à la fois terrifiante et bouleversante.

Les champions de la terre révélés lors des précédents affrontements sont désormais rejoins par Johnny Cage, un acteur de seconde zone anciennement champion d'arts martiaux. Ils vont devoir s'unir pour combattre dans le "Mortal Kombat", un tournoi qui verra la faction gagnante prendre le contrôle de toutes les autres. Le monstrueux Shao Kahn se lance dans cette bataille sanglante et espère bien conquérir le royaume terre, Earthrealm, et tous ses défenseurs.