Un gros machin tout vilain, le Pitchfork, sorte de mix entre Tom Sawyer et Jason Vorhees, est transporté à l’hôpital du coin suite à son massacre du premier épisode (ben oui, ça c'est un peu mal terminé pour lui apparemment..). Il se réveille dans l'ambulance et décide de buter tout le monde. Fraîchement débarqué, il va à l’hôpital avec l'espoir de buter tout le monde (ou à minima une Lorie Strode qui trainerait par là, on sait pas trop..)...

Mega City One, métropole plantée au milieu d'un désert de radiations. Son équilibre judiciaire est maintenu par les juges, supers flics cumulant toutes les fonctions (flics/juges/bourreaux). Une dangereuse trafiquante de drogue, Ma-Ma, contrôle d'une main de fer les gangs qui écoulent le slo-mo dans la cité, nouvelle drogue qui fait percevoir la réalité au ralenti. Le juge Dredd, un des plus durs et des plus craints, va s'octroyer une mission dans le secteur afin de former une nouvelle recrue et se confronter aux armées de Ma-Ma.

Le monde apprend à vivre sans les Avengers alors que Valentina Allegra de Fontaine tend un piège à son équipe de super-héros à la ramasse pour se sortir de déboires judiciaires importants. Plutôt que de s'entretuer, le groupe de loosers va au contraire s'unir sous la bannière des Thunderbolts pour combattre Bob, la nouvelle arme de Valentina, un curieux personnage qui va vite devenir leur pire cauchemar et libérer son côte sombre sur la ville de New-York...