Ethan Hunt est rattrapé par la patrouille et doit rendre des comptes à ses pairs. Bien décidé à ne pas laisser "l'entité" gagner la partie, il va convaincre le gouvernement de lui laisser les coudées franches pour débusquer son code source et la détruire avant qu'elle ne nous mène à la fin de l'humanité. Il va devoir repousser ses limites une dernière fois, notamment en plongeant au plus profond de la mer Baltique, dans l'épave d'un sous-marin Russe...

Lisa, alias Kali, n'a plus rien à perdre lorsqu'elle apprend que son mari a été exécuté à Rio pour étouffer un scandale de corruption. L'intégrité de celui-ci est remise en cause et sa mémoire salie. Ancienne recrue des forces spéciales, elle se rend au Brésil avec des poings, du sang et des explosifs afin de rétablir la vérité.

La jeune et talentueuse Nancy (alias Patate) surfe en solitaire sur une plage secrète du Mexique quand elle est attaquée par un monstrueux requin blanc. Elle se retrouve coincée sur un rocher à peine à 200 mètres de la plage, momentanément hors de portée des dents de la mer. Pour regagner la terre ferme, elle va devoir livrer le plus terrible des combats...