Après une expédition qui le laissera gravement touché, McCall est secouru par un bon samaritain dans le sud de l'Italie. Une fois remis sur pieds, il se sent chez lui dans ce petit village bienveillant et décide de rester quelques temps. Mais les Caïds locaux, exerçant une emprise violente sur les habitants, il sort de sa retraite et décide de protéger ses nouveaux amis.

Millie et Tom sont en couple depuis de nombreuses années et commencent à souffrir d'un quotidien de plus en plus pesant. Ils décident de déménager à la campagne afin de se donner un nouveau départ. Tom peine à percer dans la musique et est totalement dépendant de Millie, qui exerce en tant qu'institutrice et a retrouvé un nouveau poste sur place. Lors d'une randonnée censée les rapprocher, ils vont tomber sur un mystérieux endroit qui va les infecter et provoquer un changement physique particulièrement éprouvant.

Ethan Hunt et son équipe du FMI (pas le Fond Monétaire International, l'autre...) reprennent du service pour traquer une arme terrifiante qui menace l'humanité toute entière. "L'entité" contrôle nos réseaux, notre présent et devine notre futur ceci afin de prendre l'ascendant et créer un nouvel ordre mondial. Mission Impossible va relever le plus grand défi de son existence.