Tout juste sortie de prison, Asia Reaves se met à la recherche de sa jeune sœur, abandonnée à son triste sort lors d'une altercation avec leur père violent. Sa quête la mène à un bien curieux bâtiment nommé le Virgil dans lequel elle se fait recruter comme domestique. Véritable repaire de gens fortunés, son arrivée va déclencher une folie meurtrière de tous les instants. Asia devient une proie que les habitants doivent sacrifier dans la nuit pour rassasier un démon qu'ils vénèrent.

Durant l'enterrement de sa mère, une petite fille pénètre dans un mausolée. Elle tombe sous l'emprise d'un démon qui jetta un sort à tous les nouveaux nés de sa lignée. 20 ans plus tard, elle est heureuse et se marie avec un psychiatre. Mais peu à peu le malin va reprendre le dessus et semer la mort autour d'elle..

Les champions de la terre révélés lors des précédents affrontements sont désormais rejoins par Johnny Cage, un acteur de seconde zone anciennement champion d'arts martiaux. Ils vont devoir s'unir pour combattre dans le "Mortal Kombat", un tournoi qui verra la faction gagnante prendre le contrôle de toutes les autres. Le monstrueux Shao Kahn se lance dans cette bataille sanglante et espère bien conquérir le royaume terre, Earthrealm, et tous ses défenseurs.