Arthur est devenu roi de l'Atlantide et gère en même temps son nouveau rôle de Papa. Faisant face à une nouvelle menace de Black Manta, il est obligé de demander l'aide de son demi-frère Orm. Ils vont devoir affronter une entité dévastatrice se servant du désir de vengeance obsessionnel de Manta. Le sort de leur royaume est entre leurs mains...

Un bateau abandonné flottant au large du port de New-York est intercepté par les garde-côte. Après être montés à bord, ils sont brutalement attaqués par un homme en partie décomposé. La fille du propriétaire du bateau est interrogée et découvre que son père est parti s'installer sur une île tropicale, sans jamais revenir. Elle décide alors, aidée d'un journaliste, de se rendre sur les lieux afin de comprendre ce qui a pu lui arriver...

Le lieutenant Kate Sinclair, pilote de la Royal Air Force, est abattu en opération au-dessus de l'Afghanistan. Après un échange de tirs qui mènera à la mort de son coéquipier, elle trouve refuge dans un Bunker souterrain situé à proximité de la zone de combat. Elle va alors réveiller des armes biologiques mortelles, mi-humaines, mi-aliens, qui n'auront de cesse de la traquer...