Un jeune père de famille ayant vu sa femme violemment agressée par une bande de jeunes ultra-violents développe peu à peu une psychose. Une peur terrible qui le pétrifie et l'empêche de sortir de chez lui. Après l'enlèvement de son enfant lors d'une violente attaque, il va devoir s'associer au prêtre du quartier pour affronter ses peurs et pénétrer dans le quartier qu'il redoute tant, point de base de ces bandes sauvages: la citadelle.

Lors d’une randonnée en pleine nature, Macy et son compagnon Chase croisent une inquiétante créature portant un masque de poupée. Alors que Chase est violemment agressé, Macy est enlevée et conduite dans une maison isolée au cœur de la forêt. Sa ravisseuse, une femme monstrueuse obsédée par les poupées, entend faire de la jeune femme son nouvel « enfant ».

Après avoir perdu l'amour de sa vie, James Sunderland reçoit une mystérieuse lettre semblant provenir de celle qu'il croyait disparue. Intrigué, il retourne à Silent Hill, une ville autrefois familière mais désormais plongée dans un cauchemar brumeux. Au fil de ses recherches, il découvre des rues désertes, des créatures monstrueuses et des personnages énigmatiques. Confronté à ses peurs les plus profondes, James s'enfonce dans une réalité de plus en plus troublante où passé et présent se confondent. Chaque rencontre le rapproche d'une vérité terrifiante qui menace sa raison.