La ville de New-York est secouée par des crimes atroces. Durant une autopsie, un bien étrange personnage tente de voler leurs membres aux cadavres. Surpris en plein méfait, il se défenestre. L'enquête conduit rapidement vers une petite île dirigée par un savant fou se livrant à des expériences effroyables: il fait revivre les morts...

Les champions de la terre révélés lors des précédents affrontements sont désormais rejoins par Johnny Cage, un acteur de seconde zone anciennement champion d'arts martiaux. Ils vont devoir s'unir pour combattre dans le "Mortal Kombat", un tournoi qui verra la faction gagnante prendre le contrôle de toutes les autres. Le monstrueux Shao Kahn se lance dans cette bataille sanglante et espère bien conquérir le royaume terre, Earthrealm, et tous ses défenseurs.

Anna est une jeune femme souffrant d'Agoraphobie sévère. Elle n'est plus sortie de sa maison depuis 10 ans et s'occupe de son frère mourant. Lorsque 3 hommes s'introduisent chez elle par effraction, elle est incapable de s'enfuir et subit les violences de ses tortionnaires. Ce qu'ils ne savent pas, c'est que l'Agoraphobie sévère n'est pas la seule psychose qui hante Anna...