Après avoir perdu l'amour de sa vie, James Sunderland reçoit une mystérieuse lettre semblant provenir de celle qu'il croyait disparue. Intrigué, il retourne à Silent Hill, une ville autrefois familière mais désormais plongée dans un cauchemar brumeux. Au fil de ses recherches, il découvre des rues désertes, des créatures monstrueuses et des personnages énigmatiques. Confronté à ses peurs les plus profondes, James s'enfonce dans une réalité de plus en plus troublante où passé et présent se confondent. Chaque rencontre le rapproche d'une vérité terrifiante qui menace sa raison.

Après avoir survécu à son enlèvement, Finney, aujourd'hui âgé de 17 ans, tente tant bien que mal de reprendre le cours d'une vie normale. C'est désormais sa soeur Gwen qui commence à recevoir des appels du téléphone noir, mais dans ses rêves. Elle y voit sans cesse des garçons se faire pourchasser par un monstrueux tueur dans un camp de vacances appelé "Alpine Lake". Bien décidé à mettre fin à ses horribles rêves, elle persuade son frère de l'aider et de se rendre sur place...

Clover et ses amis décident de se rendre une vallée reculée ou serait disparue sa soeur Mélanie il y a un an. Sur les conseils d'un pompiste, ils se rendent dans un vieux centre d'accueil abandonné et vont très vite se retrouvés traqués par un monstrueux tueur masqué. Massacrés un par un, ils vont pourtant ressusciter afin de revivre à nouveau leur mort horrible. Seule différence, à chaque fois elle est différente.