Deux enfants jouent à se faire peur. Elles courent dans la forêt jusqu'à une ruine et se racontent l'histoire d'une malédiction qui soi-disant hanterait les lieux. On dit qu'une petite fille est enfermée dans un puits au fond de ces ruines et qu'elle ne pourrait en sortir que si on prenait sa place. A peine le récit terminé, une petite fille apparaît, lâchant quelques billes sur le sol..

Joan et ses 3 enfants emménagent dans une nouvelle maison censée les rapprocher de l’hôpital compétent pour soigner son fils James. Celui-ci est dans un état végétatif depuis plusieurs années et personne ne semble croire en sa guérison. Cependant, depuis leur arrivée, il semble peu à peu se réveiller, en même temps qu'une bien étrange présence...

Ethan Hunt est rattrapé par la patrouille et doit rendre des comptes à ses pairs. Bien décidé à ne pas laisser "l'entité" gagner la partie, il va convaincre le gouvernement de lui laisser les coudées franches pour débusquer son code source et la détruire avant qu'elle ne nous mène à la fin de l'humanité. Il va devoir repousser ses limites une dernière fois, notamment en plongeant au plus profond de la mer Baltique, dans l'épave d'un sous-marin Russe...