Les champions de la terre révélés lors des précédents affrontements sont désormais rejoins par Johnny Cage, un acteur de seconde zone anciennement champion d'arts martiaux. Ils vont devoir s'unir pour combattre dans le "Mortal Kombat", un tournoi qui verra la faction gagnante prendre le contrôle de toutes les autres. Le monstrueux Shao Kahn se lance dans cette bataille sanglante et espère bien conquérir le royaume terre, Earthrealm, et tous ses défenseurs.

A Shadyside dans l'Ohio, le bal de fin d'année est une véritable institution. Chaque année les filles les plus populaires se lancent à la conquête de la couronne de reine du bal. Lori Granger aimerait remporter cette victoire sur les autres et sur elle-même, mais elle souffre d'une réputation désastreuse liée à son terrifiant passé. Peu à peu, des gens autour d'elle commencent à disparaitre...

Une chose énorme sort de son sommeil au beau milieu des montagnes Dovre en Norvège. Après mille ans à attendre, le géant de pierre semble vouloir assouvir une vengeance et se dirige droit sur Oslo. Nora, une paléontologue renommée va devoir mettre ses certitudes scientifiques de côté afin de comprendre la créature et tenter de l'arrêter avant un désastre. Son père, un illuminé, va également lui venir en aide.