Malgré un passé sulfureux et une fermeture suite à une série de meurtres, le camp Crystal Lake voit toujours débarquer des groupes de jeunes avides d'alcool, de sexe et de sensations fortes. Suite à la disparition de sa soeur dans les environs, Clay décide de se lancer à sa recherche. Il va rapidement faire la rencontre d'un monstre habitant le camp, terré dans le sous-sol et n'appréciant guère qu'on foule son territoire...

Des prisonniers de haute sécurité vont être transférés dans une autre prison. Afin d'éviter l'attaque du bus assurant le transport, les autorités décident de prendre un itinéraire peu connu, contournant une immense forêt. Mais un chasseur bien particulier va les prendre pour cible et après avoir immobilisé le véhicule va les attirer dans son antre à l'aide de pièges cauchemardesques. Leur seul moyen de s'en sortir va être de s'allier s'ils ne veulent pas finir dans le garde manger du monstre...

Les champions de la terre révélés lors des précédents affrontements sont désormais rejoins par Johnny Cage, un acteur de seconde zone anciennement champion d'arts martiaux. Ils vont devoir s'unir pour combattre dans le "Mortal Kombat", un tournoi qui verra la faction gagnante prendre le contrôle de toutes les autres. Le monstrueux Shao Kahn se lance dans cette bataille sanglante et espère bien conquérir le royaume terre, Earthrealm, et tous ses défenseurs.