Reed Richards, un éminent scientifique, embarque avec lui son équipe pour un voyage dans l'espace dont ils reviendront changés à jamais. Leur structure moléculaire modifiée, Reed, Sue, Ben et Johnny vont désormais bénéficier de supers pouvoirs qu'ils vont mettre à profit pour protéger notre planète des menaces extérieures. Et justement, en voilà une, et une grosse. Galactus le dévoreur de planètes a jeté son dévolu sur la planète bleue...

Les champions de la terre révélés lors des précédents affrontements sont désormais rejoins par Johnny Cage, un acteur de seconde zone anciennement champion d'arts martiaux. Ils vont devoir s'unir pour combattre dans le "Mortal Kombat", un tournoi qui verra la faction gagnante prendre le contrôle de toutes les autres. Le monstrueux Shao Kahn se lance dans cette bataille sanglante et espère bien conquérir le royaume terre, Earthrealm, et tous ses défenseurs.

Robert Verne, médecin à tendances humaniste, est mandaté par l'agence de protection de l'environnement de Washington pour enquêter sur une histoire de pollution dans le Maine. Celle-ci causerait de violents troubles entre les indiens natifs de la région et les dirigeants d'une usine de papier déversant leurs déchets dans la rivière. Celui-ci va découvrir que l'horreur ne se résume pas à la présence de ces abus mais qu'ils ont engendré quelque chose de bien plus terrible...