Les champions de la terre révélés lors des précédents affrontements sont désormais rejoins par Johnny Cage, un acteur de seconde zone anciennement champion d'arts martiaux. Ils vont devoir s'unir pour combattre dans le "Mortal Kombat", un tournoi qui verra la faction gagnante prendre le contrôle de toutes les autres. Le monstrueux Shao Kahn se lance dans cette bataille sanglante et espère bien conquérir le royaume terre, Earthrealm, et tous ses défenseurs.

Lizzy est une jeune infirmière qui débute dans un hôpital psychiatrique pour adolescents ultra-violents. Lors d'une évasion, elle se fait kidnapper par 4 d'entre eux et va vivre une véritable descente aux enfers. Recherchés par un policier avide de vengeance, l'un des ados va peu à peu glisser vers la folie, frappé de plein fouet par des événements atroces qui feront de lui celui que l'on surnommera "Leatherface".

Jason Vorhees, célèbre tueur indestructible de Crystal Lake, a fini par être capturé. Cryogénisé, il est retrouvé 5 siècles plus tard par une mission d'exploration venue de la terre d'asile des humains (l'air de la terre étant devenu irrespirable). Attiré par le molosse comme par un surgelé Picard, ils ne vont pas mettre longtemps à le passer au micro-onde et à décongeler sa carcasse encore bien vaillante...