Un jeune père de famille ayant vu sa femme violemment agressée par une bande de jeunes ultra-violents développe peu à peu une psychose. Une peur terrible qui le pétrifie et l'empêche de sortir de chez lui. Après l'enlèvement de son enfant lors d'une violente attaque, il va devoir s'associer au prêtre du quartier pour affronter ses peurs et pénétrer dans le quartier qu'il redoute tant, point de base de ces bandes sauvages: la citadelle.

Une bande d'adolescents d'une colonie de vacances, remontés contre l'un de leur moniteur, Cropsy. Ils décident de lui coller une bonne frousse. Mais la blague tourne à l'accident, un incendie se déclare et Cropsy est brûlé sur tout le corps. 5 ans plus tard, il a survécu à ses blessures mais n'a pas oublié toute la souffrance qu'il a enduré. Il va retourner au camp et leur infliger une punition qu'ils ne sont pas prêts d'oublier.

Les champions de la terre révélés lors des précédents affrontements sont désormais rejoins par Johnny Cage, un acteur de seconde zone anciennement champion d'arts martiaux. Ils vont devoir s'unir pour combattre dans le "Mortal Kombat", un tournoi qui verra la faction gagnante prendre le contrôle de toutes les autres. Le monstrueux Shao Kahn se lance dans cette bataille sanglante et espère bien conquérir le royaume terre, Earthrealm, et tous ses défenseurs.