Orphelin depuis sa naissance, Ed retrouve la trace d'un frère jumeau qui lui annonce que sa mère le cherche depuis bien des années. Accompagné de Riley, sa petite amie, il décide d'aller à leur rencontre dans une magnifique région reculée du Portugal. Une fois les retrouvailles passées, un malaise commence insidieusement à s'installer. Cette nouvelle famille semble cacher un terrible secret qui va faire virer la situation au cauchemar.

Basé à Santa Mira, Conal Cochran figure parmi les plus grands fabricants de jouets du pays. Pour la fête d'Halloween, il conçoit des masques effrayants que tous les enfants s'arrachent. Daniel Challis et Ellie Grimbridge (ça ne s'invente pas) vont se lancer sur les traces de l'homme d'affaires qui projette un véritable massacre lors de la terrible nuit du 31 Octobre.

Ethan Hunt est rattrapé par la patrouille et doit rendre des comptes à ses pairs. Bien décidé à ne pas laisser "l'entité" gagner la partie, il va convaincre le gouvernement de lui laisser les coudées franches pour débusquer son code source et la détruire avant qu'elle ne nous mène à la fin de l'humanité. Il va devoir repousser ses limites une dernière fois, notamment en plongeant au plus profond de la mer Baltique, dans l'épave d'un sous-marin Russe...