Ethan Hunt est rattrapé par la patrouille et doit rendre des comptes à ses pairs. Bien décidé à ne pas laisser "l'entité" gagner la partie, il va convaincre le gouvernement de lui laisser les coudées franches pour débusquer son code source et la détruire avant qu'elle ne nous mène à la fin de l'humanité. Il va devoir repousser ses limites une dernière fois, notamment en plongeant au plus profond de la mer Baltique, dans l'épave d'un sous-marin Russe...

Les humains sont empêtrés dans une guerre contre l'Intelligence Artificielle qu'ils ont eux-même fait naitre. Joshua, ancien soldat d'élite ayant perdu toute sa famille lors d'un raid, est affecté à une mission destinée à détruire un élément essentiel des résistants de l'IA. Une arme potentiellement très dangereuse, capable de renverser le cours de la guerre...

Ellen Aim est une star internationale et lorsqu'elle se produit dans un gala de bienfaisance à Richmond, elle est enlevée par les "Bombers". Cette bande de motards dirigée par le belliqueux Raven est bien décidée à abuser de son "trophée". Reva, tenancière du bar de la ville, envoie un appel au secours à son frère Tom Cody pour qu'il accepte de secourir la star. Ancien grand amour d'Ellen, Tom accepte d'aller la chercher mais contre le versement de 10000 dollars...