Sophia, une brillante scientifique spécialiste des requins, a décroché depuis qu'elle a perdu toute son équipe lors d'une attaque terrible de Lilith, un spécimen très particulier. Mais quelques temps plus tard, une autre équipe de scientifiques découvrent que la balise placée sur ce requin est de nouveau détectée... dans la Seine à Paris...

Une petite ville côtière s'apprête à essuyer un Ouragan de catégorie 5 qui pourrait bien faire de très gros dégâts. Les habitants s'organisent et tentent de se mettre en sécurité mais plus les vents se renforcent, plus la situation devient compliquée. Le point culminant sera atteint lorsque la montée des eaux entrainera avec elle une bande de requins affamés qui vont faire de la ville leur terrain de chasse du moment...

Mike Lowrey et Marcus Burnett, équipiers inséparables, tentent de laver l'honneur de leur défunt capitaine de Police. Ils vont se retrouver aux prises avec un dangereux agent véreux, James McGrath, qui va tout faire pour les éliminer. Heureusement, les Bad Boys c'est pour la vie; et il va falloir lutter pour la conserver.