George et Edna se rencontrent lors d'un accident de la route les impliquant. La moto du jeune homme étant hors d'usage, Edna décide de l'accompagner jusqu'à la ville la plus proche. En route, ils vont être confrontés à un bien étrange personnage qui va agresser violemment la jeune femme et disparaître aussitôt. Mais le plus surprenant est que cet individu serait un vagabond décédé quelques temps plus tôt...

Après avoir perdu l'amour de sa vie, James Sunderland reçoit une mystérieuse lettre semblant provenir de celle qu'il croyait disparue. Intrigué, il retourne à Silent Hill, une ville autrefois familière mais désormais plongée dans un cauchemar brumeux. Au fil de ses recherches, il découvre des rues désertes, des créatures monstrueuses et des personnages énigmatiques. Confronté à ses peurs les plus profondes, James s'enfonce dans une réalité de plus en plus troublante où passé et présent se confondent. Chaque rencontre le rapproche d'une vérité terrifiante qui menace sa raison.

Etudiant dans une académie militaire, Stanley Coopersmith devient le souffre-douleur de ses camarades et de ses professeurs. Obligé de nettoyer les sous-sols de la chapelle, il y découvre un vieux manuscrit ayant appartenu à Esteban, un sorcier adorateur du diable ayant sévi pendant l'inquisition. A l'aide d'un ordinateur, il va peu à peu décrypter le message permettant de mener la messe noire à bien et de faire revenir Esteban dans l'espoir de se venger.