Thale déménage dans une nouvelle ville pour amorcer un nouveau départ après la mort de son père. Ses relations sont très compliquées avec sa mère et la communication est rompue. Lors d'une fête organisée près d'un bois, elle et deux autres étudiants sont brutalement attaqués par une énorme bête sauvage. Elle en réchappe miraculeusement avec une simple blessure mais semble changer peu à peu de comportement...

Une météorite s'écrase à proximité d'une petite ville Américaine et attire l'attention d'un clochard. Lorsqu'il s'approche d'elle et tente de la toucher, il se fait avaler le bras par une masse informe qui s'en est échapée. Cette monstruosité traque tout ceux qu'elle croise et se glisse partout. Très vite, elle devient impossible à arrêter. Meg et Brian, deux jeunes adultes vont tenter de survivre.

Les champions de la terre révélés lors des précédents affrontements sont désormais rejoins par Johnny Cage, un acteur de seconde zone anciennement champion d'arts martiaux. Ils vont devoir s'unir pour combattre dans le "Mortal Kombat", un tournoi qui verra la faction gagnante prendre le contrôle de toutes les autres. Le monstrueux Shao Kahn se lance dans cette bataille sanglante et espère bien conquérir le royaume terre, Earthrealm, et tous ses défenseurs.