Cinq étudiants font la fête au Mexique durant le Spring Break. Passablement éméchés, ils décident de prolonger la soirée en "empruntant" des Jet-Skis pour s'amuser en mer. Une violente collision va les immobiliser et blesser gravement l'un d'entre eux. En tentant de rejoindre la côte, ils vont faire une bien mauvaise rencontre. Un requin affamés va faire d'eux ses proies.

Réputé meilleur pilote de chasse de la marine Américaine pendant plus de trente ans, Pete "Maverick" Mitchell repousse toujours plus loin ses limites en devenant pilote d'essai. Il refuse les promotions qui l'obligeraient à renoncer au vol mais accepte de former un détachement de jeunes pilotes diplômés pour une mission spéciale qu'aucun autre pilote n'aurait pu imaginer. L'un d'entre eux est "Rooster", le fils de son ami disparu, "Goose".

Kong se cherche une nouvelle famille. Il fouille sans relâche la terre d'en dessous en espérant tomber sur ses semblables. Sa ténacité finit par payer mais sa joie sera de courte durée. Il libère un terrible danger qu'il va devoir combattre en s'alliant à celui qui était autrefois son ennemi : Godzilla.