Mike Lowrey et Marcus Burnett, équipiers inséparables, tentent de laver l'honneur de leur défunt capitaine de Police. Ils vont se retrouver aux prises avec un dangereux agent véreux, James McGrath, qui va tout faire pour les éliminer. Heureusement, les Bad Boys c'est pour la vie; et il va falloir lutter pour la conserver.

Un homme est tué à Hawaï juste après avoir expédié un mystérieux colis. Johnny et James, ses deux fils et demi-frères, sont brouillés depuis de nombreuses années mais sont prévenus de sa disparition. L'un est un policier irresponsable et totalement incontrôlable et l'autre un Navy Seals ultradiscipliné. Contraints et forcés, ils vont devoir mettre leurs griefs et leurs différences de côté afin d'enquêter sur la disparition de leur père et percer au grand jour une sombre affaire de corruption.

Un gros machin tout vilain, le Pitchfork, sorte de mix entre Tom Sawyer et Jason Vorhees, est transporté à l’hôpital du coin suite à son massacre du premier épisode (ben oui, ça c'est un peu mal terminé pour lui apparemment..). Il se réveille dans l'ambulance et décide de buter tout le monde. Fraîchement débarqué, il va à l’hôpital avec l'espoir de buter tout le monde (ou à minima une Lorie Strode qui trainerait par là, on sait pas trop..)...