Lors d'une expédition au Népal, Ted et son amie sont violemment attaqués par une bête sauvage. Mordu mais en vie, il semble atteint d'une bien curieuse maladie. De retour aux Etats-Unis, il s'installe chez sa soeur afin de renouer avec sa famille. Mais Thor, le berger Allemand de la maison, semble sur ses gardes..

Un photographe de mode et ses mannequins (sic) arrivent sur le site de la pyramide de Khéops afin de satisfaire un besoin de photos exotiques. Ils tombent par un malencontreux hasard sur une bande de pilleurs de tombes ayant mis à jour un trésor inestimable. La momie du coin, très attachée à son patrimoine, va alors se réveiller et lâcher (non, pas un pet..) une armée de morts-vivants sanguinaires aux trousses de notre joyeuse équipe..

Ethan Hunt est rattrapé par la patrouille et doit rendre des comptes à ses pairs. Bien décidé à ne pas laisser "l'entité" gagner la partie, il va convaincre le gouvernement de lui laisser les coudées franches pour débusquer son code source et la détruire avant qu'elle ne nous mène à la fin de l'humanité. Il va devoir repousser ses limites une dernière fois, notamment en plongeant au plus profond de la mer Baltique, dans l'épave d'un sous-marin Russe...